A BLAST a biológiai szekvenciák hasonlósági régióit találja. A program összehasonlítja a nukleotid vagy fehérje szekvenciákat a szekvencia adatbázisokkal és kiszámítja a statisztikai szignifikanciát. A BLAST felhasználható a szekvenciák közötti funkcionális és evolúciós kapcsolatok következtetésére, valamint a géncsaládok tagjainak azonosítására.
